Ellen Ripley starb als Heldin, aber die Weyland-Yutani Company lässt sie nicht so einfach gehen. Die Wissenschaftler des Unternehmens haben Ripley mit Hilfe alter Blutproben geklont, um sie mit der außerirdischen Königin, die in ihr gestorben ist, wieder auferstehen zu lassen. Die DNA des Außerirdischen beginnt, mit der von Ripley zu verschmelzen und verleiht ihr Stärke und Erinnerungen an die Heimatwelt des Außerirdischen. Ripley ist auf einem Weyland-Yutani-Schiff im tiefen Weltraum gefangen. Sie muss sich entscheiden, ob sie gegen das Alien in ihrem Inneren oder gegen die Menschen kämpft, die sie als Alien-Zuchtwerkzeug benutzen wollen.