Der Film spielt in einem postapokalyptischen Japan im Jahr 2071. Die Welt ist größtenteils von mysteriösen Monstern, den Aragami, zerstört worden. Eine Organisation namens Fenrir wurde gegründet, um die Aragami mithilfe von "God Arcs", Waffen, die aus Aragami-Zellen hergestellt werden, zu vernichten. Diejenigen, die sich auf die Ausrottung von Aragami spezialisiert haben, sind als God Eaters bekannt. Ursprünglich konnten ihre Götterbögen nur eine einzige Form beibehalten, aber es wurde ein neuer Typ entdeckt, der zwischen der Waffen- und der Klingenform wechseln kann. Seitdem werden sie als neue Typen und die vorherigen als alte Typen eingestuft.