Gosick spielt in dem fiktiven europäischen Land Sauville in den 1920er Jahren. Kazuya Kujo wechselt an die St. Marguerite Academy, einen Ort, an dem Mythen und Aberglaube im Überfluss vorhanden sind. Dort trifft er zufällig auf Victorique, ein mysteriöses, aber hochintelligentes Mädchen, das ihre Tage in der Abgeschiedenheit der Bibliothek verbringt und deren gesamten Inhalt liest oder Rätsel löst, die die örtlichen Detektive nicht lösen können.