Es ist das Jahr 0079 des Universellen Jahrhunderts. Zwischen dem Fürstentum Zeon, einer Weltraumkolonie, die nach Unabhängigkeit strebt, und der Erdföderation ist ein Krieg ausgebrochen. Ein Teenager muss die neue Geheimwaffe der Föderation steuern, als die Weltraumkolonie, in der er lebt, von zeonischen Mobile Suits angegriffen wird, riesigen Robotern, die von Menschen gesteuert werden. Diese neue Geheimwaffe heißt Gundam, ein weitaus mächtigerer mobiler Anzug. Die Geschichte folgt Amuro Ray und vielen anderen Zivilisten in seinem Alter, die ein Raumschiff der Föderation übernehmen und zu Soldaten werden müssen, um den Krieg gegen die Streitkräfte der Zeon während des Einjährigen Krieges zu überleben.